Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc93Q7TQK5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc93Q7TQK5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms