Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ9

Arrdc3, Arrestin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arrdc3Q7TPQ9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arrdc3Q7TPQ9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms