Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prrc2bQ7TPM1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prrc2bQ7TPM1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms