Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD3

Robo2, Roundabout homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo2Q7TPD3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Robo2Q7TPD3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Robo2Q7TPD3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Robo2Q7TPD3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Robo2Q7TPD3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Robo2Q7TPD3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Robo2Q7TPD3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Robo2Q7TPD3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Robo2Q7TPD3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Robo2Q7TPD3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Robo2Q7TPD3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Robo2Q7TPD3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Robo2Q7TPD3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Robo2Q7TPD3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Robo2Q7TPD3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Robo2Q7TPD3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Robo2Q7TPD3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Robo2Q7TPD3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Robo2Q7TPD3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms