Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rpf1Q7TND5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpf1Q7TND5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpf1Q7TND5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms