Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sbno2Q7TNB8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms