Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkd1l2Q7TN88 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkd1l2Q7TN88 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd1l2Q7TN88 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms