Protein–RNA interactions for Protein: Q7M764

Usp17le, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein E, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17leQ7M764 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp17leQ7M764 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp17leQ7M764 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp17leQ7M764 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms