Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TwistnbQ78WZ7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TwistnbQ78WZ7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TwistnbQ78WZ7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TwistnbQ78WZ7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TwistnbQ78WZ7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TwistnbQ78WZ7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TwistnbQ78WZ7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TwistnbQ78WZ7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TwistnbQ78WZ7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TwistnbQ78WZ7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TwistnbQ78WZ7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TwistnbQ78WZ7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TwistnbQ78WZ7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TwistnbQ78WZ7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TwistnbQ78WZ7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TwistnbQ78WZ7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TwistnbQ78WZ7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TwistnbQ78WZ7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TwistnbQ78WZ7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms