Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Vma21Q78T54 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Vma21Q78T54 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Vma21Q78T54 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Vma21Q78T54 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Vma21Q78T54 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Vma21Q78T54 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Vma21Q78T54 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Vma21Q78T54 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Vma21Q78T54 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Vma21Q78T54 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Vma21Q78T54 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vma21Q78T54 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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