Protein–RNA interactions for Protein: Q78J03

Msrb2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb2Q78J03 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msrb2Q78J03 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msrb2Q78J03 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msrb2Q78J03 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Msrb2Q78J03 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msrb2Q78J03 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msrb2Q78J03 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msrb2Q78J03 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msrb2Q78J03 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msrb2Q78J03 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msrb2Q78J03 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msrb2Q78J03 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msrb2Q78J03 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msrb2Q78J03 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msrb2Q78J03 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msrb2Q78J03 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Msrb2Q78J03 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msrb2Q78J03 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msrb2Q78J03 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msrb2Q78J03 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msrb2Q78J03 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msrb2Q78J03 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms