Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd3eapQ76KJ5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd3eapQ76KJ5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms