Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssh1Q76I79 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ssh1Q76I79 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms