Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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