Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ7

Spcs3, Signal peptidase complex subunit 3, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spcs3Q6ZWQ7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spcs3Q6ZWQ7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Spcs3Q6ZWQ7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Spcs3Q6ZWQ7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Spcs3Q6ZWQ7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Spcs3Q6ZWQ7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Spcs3Q6ZWQ7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Spcs3Q6ZWQ7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Spcs3Q6ZWQ7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Spcs3Q6ZWQ7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Spcs3Q6ZWQ7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Spcs3Q6ZWQ7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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