Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nup188Q6ZQH8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nup188Q6ZQH8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nup188Q6ZQH8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms