Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Topbp1Q6ZQF0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Topbp1Q6ZQF0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms