Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY2

Smg5, Protein SMG5, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg5Q6ZPY2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smg5Q6ZPY2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms