Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
H2-M2Q6W9L1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M2Q6W9L1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms