Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc88cQ6VGS5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms