Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casc1Q6TDU8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms