Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd300ld3Q6SJQ5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd300ld3Q6SJQ5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd300ld3Q6SJQ5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd300ld3Q6SJQ5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd300ld3Q6SJQ5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd300ld3Q6SJQ5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd300ld3Q6SJQ5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd300ld3Q6SJQ5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd300ld3Q6SJQ5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd300ld3Q6SJQ5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd300ld3Q6SJQ5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd300ld3Q6SJQ5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd300ld3Q6SJQ5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd300ld3Q6SJQ5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd300ld3Q6SJQ5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd300ld3Q6SJQ5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd300ld3Q6SJQ5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd300ld3Q6SJQ5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd300ld3Q6SJQ5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd300ld3Q6SJQ5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd300ld3Q6SJQ5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd300ld3Q6SJQ5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms