Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gja6Q6S5G4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gja6Q6S5G4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms