Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bnip1Q6QD59 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bnip1Q6QD59 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bnip1Q6QD59 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bnip1Q6QD59 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Bnip1Q6QD59 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bnip1Q6QD59 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Bnip1Q6QD59 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms