Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc82Q6PG04 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc82Q6PG04 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc82Q6PG04 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms