Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc85bQ6PDY0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc85bQ6PDY0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc85bQ6PDY0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc85bQ6PDY0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc85bQ6PDY0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc85bQ6PDY0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc85bQ6PDY0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc85bQ6PDY0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc85bQ6PDY0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc85bQ6PDY0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc85bQ6PDY0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc85bQ6PDY0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc85bQ6PDY0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc85bQ6PDY0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc85bQ6PDY0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc85bQ6PDY0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc85bQ6PDY0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc85bQ6PDY0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc85bQ6PDY0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc85bQ6PDY0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms