Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dtx4Q6PDK8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms