Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zbtb39Q6PDK0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zbtb39Q6PDK0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms