Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcc2Q6PDG5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms