Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RgmaQ6PCX7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RgmaQ6PCX7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RgmaQ6PCX7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RgmaQ6PCX7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RgmaQ6PCX7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RgmaQ6PCX7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RgmaQ6PCX7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RgmaQ6PCX7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RgmaQ6PCX7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RgmaQ6PCX7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RgmaQ6PCX7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RgmaQ6PCX7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RgmaQ6PCX7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RgmaQ6PCX7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RgmaQ6PCX7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RgmaQ6PCX7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RgmaQ6PCX7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RgmaQ6PCX7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RgmaQ6PCX7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RgmaQ6PCX7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RgmaQ6PCX7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RgmaQ6PCX7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RgmaQ6PCX7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RgmaQ6PCX7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RgmaQ6PCX7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RgmaQ6PCX7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms