Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAL0

Bend3, BEN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bend3Q6PAL0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bend3Q6PAL0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bend3Q6PAL0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Bend3Q6PAL0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Bend3Q6PAL0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bend3Q6PAL0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Bend3Q6PAL0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Bend3Q6PAL0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Bend3Q6PAL0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bend3Q6PAL0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bend3Q6PAL0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bend3Q6PAL0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bend3Q6PAL0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bend3Q6PAL0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Bend3Q6PAL0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bend3Q6PAL0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bend3Q6PAL0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bend3Q6PAL0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Bend3Q6PAL0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bend3Q6PAL0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bend3Q6PAL0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Bend3Q6PAL0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bend3Q6PAL0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bend3Q6PAL0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bend3Q6PAL0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bend3Q6PAL0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bend3Q6PAL0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bend3Q6PAL0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bend3Q6PAL0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bend3Q6PAL0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Bend3Q6PAL0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Bend3Q6PAL0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bend3Q6PAL0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bend3Q6PAL0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bend3Q6PAL0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bend3Q6PAL0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bend3Q6PAL0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bend3Q6PAL0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Bend3Q6PAL0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bend3Q6PAL0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bend3Q6PAL0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bend3Q6PAL0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bend3Q6PAL0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bend3Q6PAL0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bend3Q6PAL0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bend3Q6PAL0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bend3Q6PAL0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bend3Q6PAL0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bend3Q6PAL0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bend3Q6PAL0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Bend3Q6PAL0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bend3Q6PAL0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bend3Q6PAL0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bend3Q6PAL0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bend3Q6PAL0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bend3Q6PAL0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bend3Q6PAL0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bend3Q6PAL0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bend3Q6PAL0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms