Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9N8

Trak2, Trafficking protein, kinesin-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak2Q6P9N8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trak2Q6P9N8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trak2Q6P9N8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms