Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U7

Nwd2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nwd2Q6P5U7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nwd2Q6P5U7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nwd2Q6P5U7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nwd2Q6P5U7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nwd2Q6P5U7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nwd2Q6P5U7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nwd2Q6P5U7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nwd2Q6P5U7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nwd2Q6P5U7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nwd2Q6P5U7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nwd2Q6P5U7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nwd2Q6P5U7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nwd2Q6P5U7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nwd2Q6P5U7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nwd2Q6P5U7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Nwd2Q6P5U7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nwd2Q6P5U7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nwd2Q6P5U7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nwd2Q6P5U7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nwd2Q6P5U7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nwd2Q6P5U7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nwd2Q6P5U7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nwd2Q6P5U7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nwd2Q6P5U7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nwd2Q6P5U7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nwd2Q6P5U7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nwd2Q6P5U7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nwd2Q6P5U7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nwd2Q6P5U7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nwd2Q6P5U7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nwd2Q6P5U7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nwd2Q6P5U7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nwd2Q6P5U7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Nwd2Q6P5U7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nwd2Q6P5U7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nwd2Q6P5U7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nwd2Q6P5U7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nwd2Q6P5U7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nwd2Q6P5U7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Nwd2Q6P5U7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nwd2Q6P5U7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nwd2Q6P5U7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nwd2Q6P5U7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Nwd2Q6P5U7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nwd2Q6P5U7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nwd2Q6P5U7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nwd2Q6P5U7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nwd2Q6P5U7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nwd2Q6P5U7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nwd2Q6P5U7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nwd2Q6P5U7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nwd2Q6P5U7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
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