Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg2aQ6P4T0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg2aQ6P4T0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg2aQ6P4T0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms