Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms