Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A4

Vsig8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig8Q6P3A4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vsig8Q6P3A4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vsig8Q6P3A4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.4 ms