Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Kdm2bQ6P1G2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kdm2bQ6P1G2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms