Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ptpdc1Q6NZK8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ptpdc1Q6NZK8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ptpdc1Q6NZK8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ptpdc1Q6NZK8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ptpdc1Q6NZK8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ptpdc1Q6NZK8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ptpdc1Q6NZK8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms