Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HelbQ6NVF4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HelbQ6NVF4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HelbQ6NVF4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms