Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atg16l2Q6KAU8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atg16l2Q6KAU8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atg16l2Q6KAU8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms