Protein–RNA interactions for Protein: Q6IS41

Slc25a47, Solute carrier family 25 member 47, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a47Q6IS41 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc25a47Q6IS41 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc25a47Q6IS41 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc25a47Q6IS41 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc25a47Q6IS41 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc25a47Q6IS41 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc25a47Q6IS41 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc25a47Q6IS41 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc25a47Q6IS41 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc25a47Q6IS41 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc25a47Q6IS41 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc25a47Q6IS41 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc25a47Q6IS41 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc25a47Q6IS41 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Slc25a47Q6IS41 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Slc25a47Q6IS41 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc25a47Q6IS41 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms