Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CltbQ6IRU5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CltbQ6IRU5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms