Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6aQ6IE21 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud6aQ6IE21 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms