Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Best3Q6H1V1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Best3Q6H1V1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Best3Q6H1V1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
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