Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nckap5lQ6GQX2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nckap5lQ6GQX2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nckap5lQ6GQX2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nckap5lQ6GQX2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nckap5lQ6GQX2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nckap5lQ6GQX2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nckap5lQ6GQX2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nckap5lQ6GQX2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nckap5lQ6GQX2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nckap5lQ6GQX2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nckap5lQ6GQX2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nckap5lQ6GQX2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nckap5lQ6GQX2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nckap5lQ6GQX2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nckap5lQ6GQX2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nckap5lQ6GQX2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Nckap5lQ6GQX2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nckap5lQ6GQX2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nckap5lQ6GQX2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nckap5lQ6GQX2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Nckap5lQ6GQX2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nckap5lQ6GQX2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nckap5lQ6GQX2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nckap5lQ6GQX2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Nckap5lQ6GQX2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nckap5lQ6GQX2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nckap5lQ6GQX2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nckap5lQ6GQX2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nckap5lQ6GQX2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nckap5lQ6GQX2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nckap5lQ6GQX2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nckap5lQ6GQX2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nckap5lQ6GQX2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nckap5lQ6GQX2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nckap5lQ6GQX2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nckap5lQ6GQX2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nckap5lQ6GQX2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nckap5lQ6GQX2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nckap5lQ6GQX2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nckap5lQ6GQX2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nckap5lQ6GQX2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nckap5lQ6GQX2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nckap5lQ6GQX2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nckap5lQ6GQX2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms