Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gbf1Q6DFZ1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbf1Q6DFZ1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gbf1Q6DFZ1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gbf1Q6DFZ1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbf1Q6DFZ1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbf1Q6DFZ1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms