Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
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