Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cdk13Q69ZA1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdk13Q69ZA1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdk13Q69ZA1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms