Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nlrp4fQ66X05 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp4fQ66X05 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms