Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctnna3Q65CL1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ctnna3Q65CL1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnna3Q65CL1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms